ムアラフセンター・ジョグジャカルタは、2014年9月14日にゲデ・カウマン・モスクで、ゲデ・カウマン・モスクのタクミールや信徒、ジョグジャカルタのイスラム団体やラスカルの支援を受けて結成されました。ムアラフ・センター・ジョグジャカルタの初代会長はUstadz Ir. Awal Satrio Nugroho、ムアラフ・センター・ジョグジャカルタの諮問委員会はUstadz Budi Setiawan、ST. ムアラフ・センター・ジョグジャカルタは、2019年9月14日に正式にジョグジャカルタ・ムアラフ・センター財団となりました。
ムアラフセンター・ジョグジャカルタでは、改宗者の殉教、育成、支援に加え、知りたい非イスラム教徒の友人のために、イスラム教への基本的な入門プログラムを実施しています。信仰や科学に関する事柄を議論し、知識の幅を広げるために互いに洞察を加え合う、ディスカッション活動に満ちています。
